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<title>HomoloGene</title>
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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">HomoloGene</span></h1>
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<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr"><p><b>HomoloGene</b> ist ein Service des <a href="National_Center_for_Biotechnology_Information" title="National Center for Biotechnology Information">National Center for Biotechnology Information</a> (NCBI), der Informationen darüber gibt, ob und welche <a href="Homologie_(Genetik)" title="Homologie (Genetik)">Homologien</a> es für ein bestimmtes Gen in anderen Spezies gibt. Die Verarbeitung der Suchanfragen erfolgt automatisch und ist ein relativ verlässliches Werkzeug, um Verwandtschaften von Genen unterschiedlicher Arten zu analysieren.
</p>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Funktionsweise">Funktionsweise</h2></div>
<p>Die Suchmaschine benötigt dafür lediglich die Eingabe einer Aminosäuresequenz. Diese wird zunächst mit Hilfe des <a href="BLAST-Algorithmus" title="BLAST-Algorithmus">BLASTp</a>-Systems untersucht und in Hinblick auf Homologie-Kriterien verglichen. Die Eingabesequenz wird dabei mit bereits bekannten UniGene-Clustern abgeglichen.
</p><p>Die Ausgabe von HomoloGene bedient sich einer Baumstruktur, in der die Organismen von höchster bis niedrigster Homologie/Orthologie sortiert werden. Der Grad der Homologie wird vor allem anhand sogenannter konservierter Sequenzen festgelegt. HomoloGene bedient sich hier der cdart-Technologie, die ebenfalls zu den <a href="BLAST-Algorithmus" title="BLAST-Algorithmus">BLAST</a>-Tools gehört.
</p><p>Zusätzlich zu bereits bekannten Genen werden mit Hilfe eines Algorithmus ortho- bzw. homologe Abfolgen errechnet, die wiederum mit den bei UniGene gespeicherten Nukleotidsequenzen abgeglichen werden.
</p>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Unterstützte_Spezies_u._a."><span id="Unterst.C3.BCtzte_Spezies_u._a."></span>Unterstützte Spezies u. a.</h2></div>
<ul><li><i>Homo sapiens</i> (<a href="Mensch" title="Mensch">Mensch</a>)</li>
<li><i>Mus musculus </i> (<a href="Hausmaus" title="Hausmaus">Hausmaus</a>)</li>
<li><i><a href="Caenorhabditis_elegans" title="Caenorhabditis elegans">Caenorhabditis elegans</a></i> (ein <a href="Fadenw%C3%BCrmer" title="Fadenwürmer">Fadenwurm</a>)</li>
<li><i>Arabidopsis thaliana </i> (<a href="Ackerschmalwand" class="mw-redirect" title="Ackerschmalwand">Ackerschmalwand</a>)</li>
<li><i>Plasmodium falciparum</i> (<a href="Malaria" title="Malaria">Malaria</a>)</li>
<li><i><a href="Drosophila_melanogaster" title="Drosophila melanogaster">Drosophila melanogaster</a></i> (Fruchtfliege)</li></ul></div><!--htdig_noindex--><div><div class="zim-footer">
Dieser Artikel wurde von <a class="external text" title="Zuletzt bearbeitet am 2019-10-18" href="https://de.wikipedia.org/wiki/?title=HomoloGene&oldid=193223450">Wikipedia</a> herausgegeben. Der Text ist unter <a class="external text" href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.de">Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0</a> verfügbar, sofern nicht anders angegeben. Für die Mediendateien können zusätzliche Bedingungen gelten.
</div>
</div><!--/htdig_noindex--></div>
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